12点至凌晨是人体血钙含量最低的时候，有利于食物中钙的吸收，同时晚间12点至凌晨这一时间段中，人体内影响钙吸收的因素较少。
益生菌还具有减轻辐射损伤、抑制辐射后人的淋巴细胞数目下降的作用，所以最好是接受辐射之后再喝益生菌。
益生菌对于缓解心理压力过大、高度紧张和焦虑而引发的人体疲惫等有很大的帮助。午后喝一杯益生菌，可以让上班族放松心情，在整个下午都精神抖擞，更有利于提高工作效率。
如果在空腹状态下饮用益生菌，很容易刺激胃肠道排空，益生菌粉中的营养来不及彻底消化吸收就被排出，饭后喝可以减少刺激，让益生菌在胃中被慢慢吸收，并且能帮助消食。
1、益生菌通常不耐高温，高温会使益生菌失活，因此冲服温度不要超过40℃。
2、最好能随餐或饭后吃，因为空腹是胃酸会影响大部分益生菌的活性。一些耐胃酸的益生菌菌株如东海酪酸菌、凝结芽孢杆菌的服用时间限制会相对较小。
3、抗生素会杀死益生菌，因此益生菌不能与抗生素同时吃，最好在抗生素之后间隔2小时以上再服用。
另外，蒙多石散具有吸附性，能吸附有害菌，同样也能吸附有益菌，会把有益菌带离肠道，因此也要在服用后间隔2个小时再用。
酸奶和乳饮料中的益生菌种类和数量有限，且一般不耐胃酸，不能在肠道中定植，达不到治疗效果，只是对身体有一定的好处。另外，酸奶和乳饮料中的含糖量高，不建议长期服用。因此，补充益生菌还是要选一些专
门的益生菌胶囊、片剂、散剂。
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